项目概况
项目背景
随着冷冻电镜应用的不断发展,单颗粒冷冻电镜成为了结构生物学研究的重要手段之一,但模型重构通常需要对几万甚至几十万张投影图片进行分析、组装和优化,计算量十分庞大。
由月新生科构建的冷冻电镜方案,最初采用多核多线程的CPU服务器进行计算,漫长的计算时间严重阻碍了后续实验进展。但随着冷冻电镜生态优化,大量软件已支持GPU计算加速,为进一步加速实验中数据的二维和三维处理时间,现需对传统冷冻电镜方案进行异构升级。
解决方案
针对客户的异构计算需求,结合冷冻电镜实际科研场景需求,超集信息为其提供了基于EMR/SPR平台的高性能液冷工作站解决方案——ServMAX® TL40-X5。
通过双路EMR/SPR及4张专业级GPU搭载,TL40-X5单机可达128核心256线程及5940TFLOPS混合算力。在至强平台高频高核的算力支撑下,数据集准备、已处理得到高效优化,GPU则利用强大的浮点运算能力和并行处理能力实现了冷冻电镜三维重构软件的大幅提速,大大缩减了图像分析、三维重构所需时间。
并且,环温28℃条件下,TL40-X5 的 CPU 和 GPU 满载运行温度稳定在 75℃ 以下,且整机满负荷噪音低于50dB,待机噪音更低至42dB,避免降频风险同时,进一步实现了科研环境条件的优化。
客户价值
相较传统CPU方案,搭载GPU的异构平台大大提升了数据处理效率,面对200 万左右颗粒的二维分类,每一轮次处理时间仅需 30-50 分钟,时间缩减约97.5%,2000张照片的整体处理时间可以缩短到2-5天,时间缩减约85%。并且,超集信息液冷方案凭借更高的算力密度和更低的环境噪音,使冷冻电镜科研人员有了更佳的使用体验。